Dominique Gagnon est admis au Conservatoire de musique de Québec en 1989 sous la direction de Mme Noëlla Genest, où il a obtenu, en 1998, le premier prix avec « Grande distinction » à l’unanimité du jury, couronnant le niveau Supérieur II du Conservatoire de musique de Québec. Il fut boursier pour la meilleure note obtenue aux examens terminaux du Supérieur I et Supérieur II, toutes catégories d’instruments confondues. Il a pu se perfectionner, en 1997, auprès de Pierre Perdigon, titulaire de la classe d’orgue du Conservatoire de Grenoble, et en 1999, auprès de Kenneth Gilbert, professeur honoraire du Conservatoire de Paris et professeur émérite au Mozarteum de Salzbourg.
Dominique Gagnon est double-lauréat du Concours d’orgue de Québec, 1998 et 2001, où il a obtenu à deux reprises le 2e prix avec « mention spéciale » ainsi que le prix de la meilleure interprétation de l’œuvre imposée lors de l’édition de 1998. En novembre 1999, il remportait le premier prix du Concours John Robb du RCCO à Montréal.
Dominique a pu se faire entendre dans de nombreux concerts en tant que soliste partout au Québec, notamment au Palais Montcalm et à l’Oratoire Saint-Joseph du Mont-Royal à Montréal. Il est très actif sur la scène musicale en tant que soliste, que continuiste et accompagnateur pour de nombreux chœurs. Il a participé à des enregistrements pour la société Radio-Canada dans le cadre de la série « Jeunes artistes » ainsi que pour des choeurs et chanteurs dont l’album « Harmonia Voce » avec l’ensemble Polyphonia de Québec. Il fut également membre de différents jurys pour des examens terminaux ainsi que pour des concours.
Dominique Gagnon est professeur d’orgue au Cégep de Sainte-Foy et pianiste-accompagnateur au Campus Notre-Dame-de-Foy à Saint-Augustin. Il fut nommé organiste titulaire des grandes orgues de Sainte-Marie par voie de concours en 1993 et occupe ce poste depuis. Il a fondé le Festival d’orgue de Sainte-Marie en 2000, qui accueille depuis des organistes qui brillent sur la scène nationale et internationale et qui contribuent à faire connaître et rayonner ce magnifique instrument.